La recherche scientifique repose sur les grands organismes de recherche publique (CNRS, Inserm, universités, etc.) et sur des entreprises privées, formant au total plus de 510 laboratoires dans l’agglomération, qui accueillent près de 10 000 chercheurs. En 2006, la Région Rhône-Alpes a créé 14 « clusters de recherche », laboratoires lyonnais, grenoblois, stéphanois ou chambériens regroupés autours de projets communs.
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