La mission santé-handicap au sein de la direction développement territorial de la Ville de Lyon a comme objectif de se " doter d'outils de diagnostic pour mieux connaître l'état de santé de la population en général et sutout de celui des populations vulnérables en particulier , de créer une dynamique autour des questions et axes de travail portés par les associations et de soutenir la mise en place d'actions appropriées.

Elle a notamment mis en place des "Ateliers Santé Ville" dont la vocation est de mettre en place et coordonner des actions en faveur de la santé dans les quartiers relevant de la politique de la ville. Il apparaît que la Santé mentale est aujourd'hui une préoccupation majeure et des dispositifs spécifiques  sont développés au niveau de certains quartiers.