Placée sous l'autorité du Préfet de région et des Préfets de départements, la DRIRE Rhône-Alpes agit au service de plusieurs ministères en charge de l'industrie et de l'énergie, de l'écologie et du développement durable, de la recherche et de la technologie, ainsi que des transports. Elle compte près de 330 agents issus, pour les deux tiers, du domaine technique.

Les principales missions de la DRIRE Rhône-Alpes concernent la sécurité des biens et des personnes, la protection de l'environnement et le développement économique industriel. Son siège régional, basé à Lyon est structuré en quatre divisions spécialisées :
- la division Développement industriel et technologique est chargée de connaître et d’animer le tissu industriel régional et d’assurer les conditions favorables au développement des entreprises, par un accompagnement d’actions collectives et la mise en place de réseaux d’entreprises regroupées par thématiques sectorielles (métallurgie, chimie, industrie agricole, textile…). En ce sens, elle a rédigé en 2004 une monographie de l’industrie en Rhône-Alpes, en collaboration avec l’INSEE, et participe à l’information des services de l’Etat ;
- la division Environnement industriel qui suit et contrôle, à travers près de 80 inspecteurs des installations classées, les activités industrielles pouvant avoir un impact sur l’environnement. Elle vise à prévenir les risques accidentels et chroniques, ainsi que les nuisances pour la santé et l’environnement. En ce sens, la division participe à l’élaboration du Plan Régional Santé Environnement (PRSE), informant sur les conséquences sanitaires de l’exposition à certaines pollutions. De plus, elle contrôle les circuits d’élimination des déchets et coordonne les actions de lutte contre la pollution atmosphérique ;
- la division Contrôles techniques chargée de veiller à l’application des règles sur la sécurité  des véhicules avant leur mise en service (poids-lourds, transport en commun et transport de marchandises dangereuses) et de surveiller leur contrôle technique. De plus, elle veille au respect des règles de sécurité relatives aux canalisations de gaz, d’hydrocarbures et de produits chimiques, ainsi qu’aux équipements sous pression (réservoirs d’air, extincteurs, bouteilles et sphères de gaz, générateurs de vapeur, …) ;
- la division Energie, électricité et sous-sol qui autorise et contrôle les ouvrages de production et de transport d’électricité. Elle est également chargée de la gestion et la valorisation des ressources minérales et l’utilisation des ressources énergétiques, au regard des besoins de l’économie, de l’environnement et de la sécurité des personnes.

Par ailleurs, la DRIRE Rhône-Alpes regroupe trois services de compétence nationale. La Division Nationale des Eaux Minérales et Thermales (DNEMT) et le Bureau d'Etude Technique et de Contrôle des Grands Barrages (BETCGB) apportent un appui technique, réglementaire et administratif à la DRIRE. Le Bureau d'Analyse des Risques et Pollutions Industrielles (BARPI) collecte, analyse et intègre dans la base ARIA* les données relatives aux accidents et pollutions accidentelles français et étrangers (résumés disponibles sur le site www.aria.ecologie.gouv.fr).
Enfin, la Délégation Régionale à la Recherche et à la Technologie (DRRT) est également accueillie au sein de la DRIRE Rhône-Alpes. Elle vise à coordonner l’action des établissements publics, des universités et des organismes de recherche avec les orientations de la politique nationale et des programmes d’action du ministère. De plus, elle est chargée d’organiser les transferts de technologies et d’encourager la diffusion de la culture scientifique, technologique et industrielle.

* ARIA : Analyse, Recherche et Information sur les Accidents