Les projets retenus s'inscrivent dans les priorités définies par les différents  partenaires :

> pour l'Etat et la Région, dans le contrat de plan signé le 16 mars 2000,
> le Département, compte tenu de ses priorités, s'engage pour la création du Cancéropôle, le programme de renouvellement urbain et celui du développement économique (Eurexpo). Par ailleurs, il conduit les projets Leslys et Musée des Confluences qui participent au développement de l'agglomération.

Ce contrat comprend six chapitres :

1. Le développement des transports en commun

2. Le renouvellement urbain permettant une accélération sensible du rythme de réalisation des opérations pour faire face au déficit de logement social dans l'agglomération ;

3. La création du Cancéropôle Lyon Rhône-Alpes

4. Le développement économique

5. L'attractivité du territoire et l'environnement

6. Les équipements de centralités, de culture, et de rayonnement

Les trois premiers chapitres concernent les actions qui constituent les priorités de l'Etat et auxquelles celui-ci s'associe.

La Région, conformément aux orientations arrêtées au titre de sa politique contractuelle d'aménagement et de développement du territoire (Contrat de Développement de Rhône Alpes) intervient au titre du contrat d'agglomération pour : la création du cancéropôle, les programmes de développement des transports en commun ; de développement économique ; d'attractivité du territoire et pour les équipements de centralités.