La Fédération protestante de France (FPF), créée en 1906, comprend actuellement 24 unions d’Eglises et plus de 500 communautés, institutions, œuvres ou mouvements protestants regroupés autour d’une charte commune. Tout en refusant l’exclusivité du protestantisme français (des Eglises et mouvements protestants ne sont pas membres de la FPF), elle est l’organisme le plus représentatif de la diversité du protestantisme français, puisque il est le seul à regrouper des membres de ses différentes familles, luthéro-réformées, évangéliques et charismatiques. Elle a donné le jour en 1994 à la Fédération protestante du Lyonnais, intitulée depuis 2002 Antenne Lyonnaise de la Fédération Protestante de France. Le but de cette antenne est de faire vivre localement la réalité du mouvement fédératif national, à la fois dans ses services communs (aumônerie des prisons, aumônerie hospitalière, aumônerie aux armées), dans la transmission locale de ses prises de position nationales et aussi d’œuvrer au témoignage et à la visibilité du protestantisme dans l’agglomération. Pour ce faire, elle organise des rencontres et des débats, et encourage le dialogue et la solidarité entre ses membres, tout en assurant l'accueil des protestants non affiliés à la fédération, en particulier par le dialogue avec les Eglises protestantes issues de l’immigration qui sont aujourd’hui une composante importante du protestantisme en France.  Elle est a participé au "Forum protestant", qui s'est tenu en 1998 à la Halle Tony Garnier et a réuni près de 5000 personnes et à l’action commune « 2003 année de la Bible », par l’organisation d’un salon de la Bible. La Fédération protestante du Lyonnais est aussi tournée vers le grand public, au travers de ses engagements, luttes et débats dans différents domaines (famille, violence, économie, laïcité...). Elle se veut vigilante face aux mouvements sectaires et participe à la solidarité internationale à différents niveaux (travail de réflexion sur l'Afrique, échanges de pasteurs entre l’Afrique et la France).

Remarques : L’antenne lyonnaise de la FPF qui est déjà en lien avec la Chaire Œcuménique Catholique, l'Evêché de Lyon, R.C.F., la revue Réveil..., souhaite tendre la main à d'autres unions d'églises et faire davantage entendre la voix des protestants auprès des élus locaux, sur certains sujets de société et sur la place du spirituel dans la vie quotidienne.