Depuis 1986, ATD-Quart Monde portait un projet innovant dans la région Rhône-Alpes pour créer un observatoire social. Des associations, des universitaires et des partenaires sociaux ont été mobilisés et c'est en 1992 que le Préfet de Région et le Président du Conseil Régional décident de financer une structure légère ayant pour objectif « de bien mesurer l'ampleur des phénomènes de grande pauvreté, de mieux comprendre les processus qui y conduisent et de disposer d'outils d'évaluation des actions » .

En 1994, la Mission Rhône-Alpes d'Information sur l'Exclusion est inscrite dans le contrat de plan Etat-Région et dotée de moyens supplémentaires avec un rôle accru qui la mène à assurer aujourd'hui trois missions principales :
- une mission d'observation et de veille : la MRIE publie chaque année un dossier qui dresse un tableau de l'évolution de la précarité en Rhône-Alpes,

- une mission d'étude et d'animation de la réflexion autour de différents thèmes : la MRIE organise des groupes de travail réunissant des personnes venant d'administrations régionales ou départementales, du monde associatif et universitaire. C'est ainsi qu'elle peut tenir un rôle d'information et d'interpellation auprès des acteurs et des décideurs chargés de mettre en œuvre les politiques
de lutte contre l'exclusion,

- une mission d'appui à des initiatives et de communication visant la sensibilisation des acteurs engagés sur le terrain ( à travers des l’animation de rencontres locales, de formations, et différents outils de diffusion).

Confortée dans ses missions par la loi de 1998 de lutte contre les exclusions, la MRIE compte aujourd’hui 7 salariés.